Anonim

A szerkesztő megjegyzése : Pardis Sabeti, MD, DPhil, a Harvard Broad Institute és a Massachusetts Institute of Technology (MIT) tagja, valamint a Rendszerbiológiai Központ és a Harvard Egyetem Szerves és Evolúciós Biológia Tanszékének professzora. Algoritmusokat dolgoz ki az emberek legpusztítóbb és leghalálosabb betegségeinek, például az Ebola, a Lassa-láz és a Zika genomjainak evolúciójának vizsgálatára.

Elmenekül az iráni forradalomtól, álmodik a MIT-ről

Eric J. Topol, MD : Helló. Eric Topol vagyok, a Medscape főszerkesztője. Különleges kiváltságom, hogy beszélgethessünk Pardis Sabeti-vel. Rendkívüli tudós és orvos a Harvard Orvostudományi Iskola és az MIT széles intézetében. Az életének és karrierjének íveiről fogunk beszélni, kezdve akkor, amikor 2 éves korában ide költözött Teheránból.

Pardis Sabeti, MD, DPhil : Igen. Az iráni forradalom idején érkeztünk az Egyesült Államokba, és itt volt menekült státusza. Aztán Hawaii-ba, New Jersey-be, Grúziába és Floridaba költözöttünk, és Floridaba telepedtünk.

Dr. Topol : Egy ponton nem volt biztos abban, hogy virágboltot fog tulajdonolni, regényírónak vagy orvosnak lenni. Igaz?

Dr. Sabeti : Ekkor voltam körülbelül 6 éves. Nagyon tetszett a virágokat, így gondoltam: "Ez az életnek tűnik." Gyerekként szerettem írni. Apám mint bevándorló és a forradalom gyermeke szórakoztatta magát, mondván: "Bárki lehet, akit a világon szeretnél lenni: ügyvéd vagy orvos." A nővérem ügyvéd lett, és én orvosmá vált, de egyikünk sem gyakorol.

Dr Topol : A zene nagy része volt az életednek. Mikor gyökereződött ez?

Dr. Sabeti : Csak a végzős iskolába került. Egész életemben szerettem a zenét, és gyerekkor játszottam egy kis zongorát. Mindig koncertekre mentem. Így élveztem az időt. Amikor általános iskolába jártam, két amerikai barátom volt és együtt voltunk Angliában. Mindig "fantasy band" -ot játszanak, és együttes neveket és ilyen cuccokat alkotnak. Egy este azt mondtam: "Miért folytatod a fantázia-együtteset? Miért nem indítod el csak a zenekarot?" Azt mondták, hogy legalább ritmusszakasznak kell lenniük, tehát másnap basszust vásároltam, és elkezdtem az utamat.

Dr Topol : Manapság egy énekes és író vagy egy rock zenekar számára. Milyen gyakran vesz részt ebben?

Dr. Sabeti : lehajlik és viaszol . Ez nem igazán elősegíti a kar életét. Egy időre ledobtam, aztán baleset történt, és újra felvettem. A zene nagyszerű, mert a lélek csak időnként beszélni akar, és lehetősége van rá. Nagyon szórványos, de nemrég írok zenét.

Dr Topol : Valahogy vagy, a MIT-en landoltál.

Dr. Sabeti : A 6. osztályban felmerült az a gondolat, hogy MIT-be menni. Matematikai tanárom egy 270 versenyszámot mutatott be: A MIT gépészmérnöki osztályának van egy olyan versenye, amelyben mindenki robotokat épít, amelyek versengnek egymással. Gyerekként láttam ezt a videót, és azt gondoltam: "Itt kell lennem." Azóta bekapcsoltam a MIT-re, mint álomiskolára.

Dr Topol : Te is Rodosz Tudósává váltál, és Oxfordba mentél.

Dr Sabeti : Bizonytalan tapasztalat volt közvetlenül a főiskola után ezen a csodás vidéken, amely Oxford volt, és sok egzisztenciális válság történt közvetlenül a főiskola után. Nagyon informatív és nagyszerű élmény volt.

Dr. Topol : Addigra már belekezdett a teljes szelekcióba, mutációba és evolúciós biológiába?

Dr Sabeti : Nem. Szerintem éppen ez történt. MIT-be jártam és szerettem az összes mérnököt, de még mindig azt gondoltam, hogy orvosnak kellett lennem. Orvosi iskolába akartam menni, de ezt az ösztöndíjat egy cápára kaptam. Azt tervezem, hogy visszamegyek az orvosi iskolába. Útközben valahogy PhD diplomát szereztem. Érdekes élmény volt ott. Rövidebb PhD pályájuk volt. Ekkor kezdtem el ezt a munkát, és ez megváltoztatta az életem irányát.

A kitörés közepén

Dr Topol : És akkor elmentél az orvosi iskolába - nagy elkötelezettség. Amikor elkezdte karrierjét, tudta, hogy az Ebola és Zika genomi járványtani feladatáért felelős lesz?

Dr. Sabeti : Természetesen nem. Mivel soha nem akartam tudósként lenni, nem volt nagyon konkrét útvonalam ahhoz, amit tenni akartam. Úgy érzem, hogy egy vadász vadászatban vagyok; Pontosan nem tudom, merre megy, de ez az út már egy ideje megragadta a figyelmemet.

Dr. Topol : Ez elég vadászat. Csak az, amit tett az Ebola-val - 2014-ben „Év Személyének” nevezték és a világ 100 legbefolyásosabb embere közé tartozott. A laboratóriumi emberekkel és sok más emberrel együtt Nyugat-Afrikába mentél, hogy megpróbáld megszerezni a szörnyű Ebola-járvány titrálásához szükséges ismereteket. Meg tudsz mondani nekünk erről?

Dr. Sabeti : Persze. Először is, csak egy kicsit vagyok. A nap végén ebola harcosokat elismerték az általunk közösen végzett munkáért. Kiváltságom volt, hogy példaként nevezzem az embereket, de ez kollektív erőfeszítés volt. Számunkra a látszólag kicsi szerepet játszottuk az, hogy természetesen a genomika világából származunk - levágtam a fogaimat a Human Genome Projektnél -, ahol az adatok megosztása és a tudomány iránti nyitott érzés csak adott.

Ez egy kitörés, melynek közepén találtuk meg magunkat, mert az az oldal jött, ahol Afrikában dolgoztunk. Mivel mindent megtettünk azért, hogy segítsünk az ottani munkatársainknak és partnereinknek, és hogy felhívjuk a figyelmet, elkezdtük publikálni a tudományt erről. Elkezdtük adataink kiadását a laboratóriumba. Érdekes az, hogy úgy döntöttünk, hogy nem törődünk az elismeréssel; csak az adatokat akartuk eljuttatni a világra. Paradox módon, erre hívtuk fel a figyelmet. Nyilvánvalóan szokatlan volt az adatok nyílt megosztása, mihelyt elkészítették őket. Ez hívás lett a közösség felé.

Nem törődött az elismeréssel; csak az adatokat akartuk eljuttatni a világra.

Dr Topol : Az életedet sorra helyezte, hogy ezt a munkát elvégezze. Milyen volt?

Dr. Sabeti : Hogy őszinte legyek, tudósként ezt kockáztatja. Egy ideje dolgoztunk a Lassa-lázon. Korábban karanténban voltam. Kockázatot vállalunk, de ezek nagyon mérhetőek, kiszámítottak. Alapvetően minden esetben a klinikusok fertőződtek meg. Láttuk ezt az egész táblán a kitörés során. Kutatókként nagyon zárt környezetben dolgozunk, és nagyon jól tudjuk elkülöníteni a dolgokat. Tényleg a klinikusok szolgálatában vagyunk. Kockázatot vállalunk, de számunkra nagyobb a kockázata, hogy autóbalesetben szenvedünk, mint az Ebola-val fertőzött. Megtiszteltetés volt, hogy ott vagyunk, hogy támogassuk őket.

Dr. Topol : A közelmúltban részt vettél a Zika vírus történetében. Hol állunk ezzel?

Dr. Sabeti : Zika más. Az Ebola gyorsan növekvő járvány volt. Ez volt az egyik vírus, amely átvihet emberről emberre, nagyon akut fertőzésekkel és nagyon magas halálozási arány mellett. Ijesztő esemény volt. Zika kevésbé halálos. Nem továbbítja olyan könnyen. Általában szúnyogok. De ez egy nagyobb kihívást jelentő vírus a harcban; ez elterjedtebb, és a szúnyogokat nehéz kezelni. A vírus kissé elrejti magát alacsony koncentrációban a vérben rövid ideig, így a diagnózis kihívást jelent. De nagyon fontosvá válik a terhességre és a Zikával született anyák gyermekeire gyakorolt ​​hatása miatt. A Zika zsigeri reakciót vált ki mindannyiunkban, mert érinti egy kiszolgáltatott lakosságot, amelyről mindannyian törődünk.

Kérjük, játsszon az adatainkkal

Dr. Topol : 2015-ben TED-beszélgetést adott arról, hogyan fogunk kezelni a következő halálos vírust. Össze tudja foglalni azt, amit akkoriban beszélt?

Dr. Sabeti : Ez volt az Ebola-járvány közepén. Felkértek tőlem, hogy beszéljen a TEDWomennél. Csak megbeszéltem, mi volt akkor az agyamban. Nem igazán gondoltam ki, hogy pontosan mi lesz az üzenet, és nem is tudtam, feltétlenül az, hogy online fogják közzétenni. Valójában énekeltem a beszélgetésem során. Jó volt a szobában, de ki akarták vágni és megfelelő hosszúságúvá tenni [a TED Talks online számára]. Csak szórakoztam vele. Az üzenet a kitörésekről és azok félelmetes voltáról. De ez egy háború, amelyet nyerhetünk - hanem együttműködés révén nyerünk. Nagyon különbözik az emberiséget fenyegető más típusú fenyegetésektől. Ezt éreztem - az emberi képesség és szeretet ereje az ilyen kihívások leküzdésére.

Dr Topol : Valójában ez az egyik dolog, amit alá akarom hangsúlyozni a beszélgetésünkben. Összeállított egy globális együttműködési motort, amely elengedhetetlen az adatok valós idejű megosztása során egy vírus mutációinak a Sherlockian által végzett vizsgálatában, amely a vírus mozgását magyarázza. A szekvenálás révén megvan ez a figyelemre méltó eszköz. De ha nem az a tény, hogy a világ minden részét és részeit össze tudná állítani, akkor lehet, hogy nem működik túl jól, igaz?

Dr. Sabeti : Teljesen. Nagyszerű emberek vannak a laboromban, akik hihetetlenül együttműködnek. Minden ponton azon gondolkodunk, hogyan lehet másokkal kapcsolatba lépni. Szórakozás volt. Sok együttműködésünk akkor történt, amikor adataikat közzétettük az interneten. A világ egyik legnagyobb vezetõje felkeresett minket és azt mondta: "Ez volt egy hiba? Meg akarta engedni ezt?" Azt mondtuk: "Nem; kérem, játsszon vele."

Így alakulnak ki az együttműködések. Történelmileg a közösség nagyon komoly és versenyképes volt. De van egy koalíció a hajlandóak között. Úgy tűnt, hogy amint megcsináltuk, egy embercsoport valóban ragyogott. Izgatottak voltunk, hogy lehetőségünk volt együtt dolgozni.

Dr. Topol : Ez inspiráció volt, mert még soha nem láttam ilyen effusive megosztást, ilyen gyorsan és globálisan elosztva. Ez egy új modell, és kívánom, bárcsak mindent megtehetnénk az összes gyógyászati ​​kutatás során.

Nincs hiány a kitörési rejtvényekből

Dr Topol : Ön elég fiatal, és kicsit teljesített. Van egy Nemzeti Egészségügyi Intéző Intézet díja, 34 fős labor, és sok minden zajlik. Honnan jössz innen? Mi a karriered következő szakasza?

Dr. Sabeti : Sok a tennivaló a járványok során. Tényleg csak megkarcoljuk a felületet. Ezen a ponton azonosítjuk a problémát. Nagyon izgalmas helyen vagyunk a technológia számára. Ha megfelelő módon használjuk fel, akkor van egy erős hálózatunk, amely nagyon gyorsan képes reagálni. Erre vagyok szentelve. Ez olyasmi, amit már régóta akartam csinálni. A laboratóriumi hallgatóimat szenteltem. Imádom a munkámat és azt, amit csinálok.

És költöztem. Ez a vadász vadászat más projektekbe vezetett engem, amelyben érdekel. Pályafutásom során olyan területeken mentem, ahol a váratlan esemény bekövetkezik, vagy nem feltétlenül üldözöm a nyilvánvaló következő nagy dolgot. Senki sem tudott a Lassa láz vírusáról, de erõsen éreztem magam. Van néhány ilyen rejtvény, amelyeket meg akarok oldani.

Dr Topol : Gondolod, hogy belekapcsolódik ahhoz a gondolathoz, hogy rutinszerűen korai szekvenálást kell alkalmaznunk a fertőzés diagnosztizálására?

Dr. Sabeti : Ezt már megcsináljuk. Michael Wilson nagyszerű előadást tartott ma reggel [a Future of Genomic Medicine X-en]. Nagyon hasonló dolgokat csinálunk klinikánkban Bostonban. Számos esetet diagnosztizáltunk kutatási megközelítés segítségével, de jóval a klinikai diagnózis előtt.

Dr Topol : Szinte készen állsz arra, hogy elkezdje ezt a klinikai alkalmazást?

Dr. Sabeti : Még van még néhány tennivaló, de erõs adatok. Készítünk egy CLIA laboratóriumot, és ezt kidolgozzuk. Az egész országban zajlik. A sok szekvenálást végző kutatóközpontok megpróbálják megteremteni ennek képességét.

Dr Topol : Látod-e azt a napot, amikor a MinION szekvenáló USB-eszközöket szekvenálásra használják a világ távoli részein, és valamilyen módon az adatok interneten keresztül történő beolvasására, hogy így megtudják a hibát?

Dr. Sabeti : Teljesen. A MinION egy igazán erős modell. Nyilvánvaló, hogy ezeknek a dolgoknak tovább kell haladniuk. Látjuk, hogy a genomtechnika messze meghaladja Moore törvényét. Nem szabad túl sokáig tartania, amíg mindannyiunknak van egy házunkban. Őszintén szólva, senki sem szabad kórházba menni, ha fertőzése van. Cesspool lesz; újabb fertőzést kapsz. Végül erre a pontra jut. Még ha bejuttatjuk őket a fő klinikákba és a nagyvárosokba, akkor nagy különbség lenne.

Dr. Topol : George Orwell a kórházat "a sír előcsarnokának" hívta. Nem tudta, hogy a nosokomiális fertőzés oka.

Szeretnék órákig beszélni veled, és tudom, hogy a hallgatók nagyon érdekeltek, mert annyit tettél, hogy megváltoztassátok a gyógyászat arcát ezekben a globális járványokban. Hálásak vagyunk neked. Nem csak ezt, de olyan sok kiváló embert kiképeztél. Nagy örömünkre szolgál, hogy sikerült segítenünk az orvosi közösség embereit megismerni téged, mert nincs sok olyan ember, mint te, Pardis.

Köszönjük, hogy csatlakozott hozzánk, és köszönöm mindenkinek, aki hallgat. Ez egy szórakoztató vita volt, és azt hiszem, hogy a következő években sokkal többet fogunk hallani a Pardis-ról. Köszönöm.