Anonim

Keresek a végső forráskódhoz

Eric J. Topol, MD: Helló. Eric Topol vagyok, a Medscape főszerkesztője, és nagyon izgalmas egy-egy ülésem van Atul Butte-val, aki a Stanford Egyetemen költözött a San Francisco-i Kaliforniai Egyetembe (UCSF). Vezetni fogja a Számítástechnikai Egészségtudományi Intézetet. Atul, csodálatos, ha esélyt akarunk látogatni veled.

Atul Butte, MD, PhD: Nagyszerű itt lenni a jövőbeni genomi gyógyászati ​​találkozón.

Dr. Topol: Veterán vagy, már itt voltál, de a munkád rendkívüli volt. Beszéljünk a hátteréről gyermekkori endokrinológusként és számítógépes tudósként is. Hogyan került be mindkét területre?

Dr Butte: A középiskolában már tudtam, hogy szeretem a számítógépes ismereteket és az orvostudományt. Arra gondoltam, hogy radiológus leszek. Abban az időben a National Geographic borítóján szerepelt ez a technológia, az úgynevezett "MRI" és "CT szkennelés", majd amikor az orvosi iskolában voltam, elkezdődött a genomprojekt. Rájöttem, hogy az emberiség végső forráskódjának kitalálása az, amit akartam csinálni. Ez az 1990-es évek elején volt.

Gyermekorvosként képztem, mert számomra a gyermekgyógyászat a legközelebb a genetikához. A gyermekkori betegek nem sokat tesznek maguknak; az egész genetika. Aztán végeztem még néhány edzéssel, és 10 éve vagyok a Stanfordban. Most az UCSF-be költözök.

Az Akadémia szerepe a világ megváltoztatásában

Dr. Topol: Mesélj nekünk a Stanfordban töltött 10 évről. Mit tudtál elérni abban az évtizedben?

Dr Butte: Az első napon karrierfejlesztési díjjal kezdtem - egyike azoknak a K-díjaknak, amelyeket középiskolai oktatóknak várunk. Egy 30 fős csapattal zárulok. 200 publikációt tettünk közzé, és 15 vagy 16 Nemzeti Egészségügyi Intézet (NIH) támogatást kaptunk. Nem azt mondom, hogy büszkélkedni, hanem hogy azt mondjam, hogy a jövő junior oktatója ezt megteheti. Meg lehet változtatni a világot azáltal, hogy ragaszkodik a tudományos életbe. Még mindig nagy tudományos rajongó vagyok; ezért maradok tudós, amikor UCSF-be költöztem. Ma nehezebb éghajlat, de szerintem még mindig a világ megváltoztatásáról van szó. Az NIH elismeri ezt. Meg lehet csinálni.

Dr Topol: Amikor a nagy adatokra és az orvostudományra gondolok, eszedbe jut, de valószínűleg egész idő alatt nagy gondolkodás volt. Nagy látomásod volt arról, hogy hová veheti ezt, igaz?

Dr Butte: A mai kifejezés "nagy adat". Akár "precíziós orvoslásnak", akár "számítástechnikai egészségnek" hívják, ugyanazt jelentik - az első vonalbeli gyógyszert. Az orvostudomány adat szempontjából egyre számítógépesebbé válik.

Két nagy sofőr van. Ezen a találkozón a genomról és a genomprojektről beszélünk. Sok bájtot mérnek ott, de az orvostudományban több olyan dolgot rögzítünk, amelyet teszünk, vagy amit a betegektől mérünk az elektronikus egészségügyi nyilvántartásba. A kettő közötti ütközés vagy szinergia izgalmas hely lehet.

Dr Topol: Amikor az új intézetnél indul, nehéz lesz mindenkit hagyni a Stanfordon, vagy magával viszi néhányat az UCSF-be?

Dr Butte : Remélem, hogy elviszem az összes csapatomat, plusz vagy mínusz néhányat, akiknek ingázási okokból kell maradniuk. Remélem, hogy elviszem mindet.

Hogy világossá váljak, nem voltam boldogtalan Stanfordban. Megborzongtam. Csak az, hogy az UCSF-nek nagyon sok felső vezetése van, aki érti ezt a "precíziós orvoslás" kifejezést. Részt vesznek az Orvostudományi Intézet precíziós orvostudományi terveivel. Még négy évvel ezelőtt, Keith Yamamoto és Sue Desmond-Hellmann, akik most a Gates Alapítvány tagjaivá váltak, részt vettek ebben a toborzásban. Ez a toborzás 4 éve folyik. Úgy látom, hogy új épületet teremtenek a számítógépes egészség körül, és rengeteg jövőbeli potenciállal rendelkezik.

Otthon a nagy adatokhoz

Dr Topol: Hova megy ez a mező az UCSF-en és sokkal nagyobb léptékben? Terabyte adatot fogunk előállítani egyénenként. Lesz érzékelőink a vérnyomásért és minden pulzusért. Ezeknek az adatoknak nincs otthonuk. Hogyan oldjuk meg ezeket a problémákat?

Dr Butte: A jövő bonyolult lesz, mielőtt egyszerűbbé válik. Több millió darab adattal rendelkezünk több millió emberről. Ma reggel a találkozón Francis Collins-t hallottuk az amerikai önkéntesek csoportjairól. Az UCSF ennek része lesz. A Kaliforniai Egyetemen (nem csak az UCSF-nél, hanem a Kaliforniai Egyetemen is) 12-13 millió beteg van, akik szívesen részt vesznek ezen erőfeszítésben. Ez annak az oka, hogy mozogok. Az egyének képesek több mérést végezni magukon, legyen az alvásmintáik vagy pulzusszámuk.

Nem hiszem, hogy az adatok egy helyen, hanem különböző helyeken fognak élni. Különböző helyeken akarnak megismerni ezeket az adatokat. A betegek és az egyének jobban ellenőrizhetik adataikat (pl. Az adatok megosztásának módját), és az orvostudománynak gyorsabban kell mozognia, és az adatok lesznek a megoldás.

Dr Topol: Ön elhagyja a magán egyetemet - a Stanfordot -, amelyet Start-up University-nek is hívnak.

Dr Butte: Így van.

Vállalkozás: Nem arról szól, hogy meggazdagodunk

Dr. Topol: Ez eléggé terep a vállalkozói szellem számára. Ön elindított egy pár céget. Most egy állami egyetemen megy. Van valamiféle tulajdonsága erről?

Dr Butte: Egyáltalán nincs nálam. A vállalkozói szellem szempontjából az UCSF ott van. Kicsit intézményesebb. Reg Kelly már több mint 10 éve dolgozik valamelyik „QB3” nevű munkán - az UCSF, a Santa Cruz-i Kaliforniai Egyetem és Berkeley között. Az épület mellett, ahol én leszek, inkubátor hely van ezeknek a vállalatoknak az UCSF-nél. Számos más vállalat, például a Johnson & Johnson és mások, már építettek épületeket a Mission Bay környékén, hogy ezeknek a biotechnológiai és technológiai vállalatoknak néhány részét inkubálják.

Nem kevésbé vállalkozom; A vállalkozói szellemre gondolok. Nem mindig azért említem a vállalkozást, mert megpróbálok meggazdagodni, hanem azért, mert a laboratóriumom úgy véli, hogy ha meg akarjuk változtatni a világot, akkor nem tudunk csupán róla papírokat írni. Így jutunk el a betegekhöz.

Dr. Topol: Ez nagyon fontos üzenet a kijutáshoz. Ön feleségével létrehozta az egyik ilyen társaságot, igaz? Meg tudsz mondani nekünk erről?

Dr Butte: A cég neve NuMedii. A feleségem és én, és most mások is, egy olyan társaság részét képezzük, amely a drogok áthelyezését célozza - új gyógyszerhasználatot talál. Mindannyian tudjuk a klasszikus történeteket a szívgyógyszerekről, érdekes mellékhatásokkal, amelyek olyan gyógyszerekké válnak, mint a Viagra® és a kopaszodáshoz használt minoxidil. Ahelyett, hogy véletlenül találná ezeket az új felhasználásokat, mi lenne, ha szándékosan találná meg őket? Mi lenne, ha nyilvános nagy adatok felhasználásával találnák őket, az a hatalmas erőfeszítés, amelyet az NIH a laborokban finanszíroz? Ezeket az adatokat meg kell osztani az interneten, így rájöttünk, hogy újra felhasználhatjuk a gyógyszerekkel és a betegségekkel kapcsolatos adatokat, összeállíthatjuk ezeket a két adatot, és megtalálhatjuk a drogok ezen új felhasználási lehetőségeit. Nehezebb ebből kiindulni.

Dr. Topol: Már közzétette néhány megállapítását.

Dr Butte: Publikáltunk párat; legutóbbi, tavalyi kiadványunk egy antidepresszánsról szól, amely látszólag megolvasztja a kissejtes tüdőrákot. Ez egy példa arra, hogyan mentünk a tényleges számítási adatoktól a klinikai vizsgálat elindításához körülbelül 15 hónapon belül. A tárgyalás 50 000 dollárba került, nem pedig 50 millió dollárba. Ez természetesen nem milliárd dollár. Bizonyos értelemben a jövőben több drogot kell felvenni a jövőben, és sokkal gyorsabban és olcsóbban kell bevonni őket a betegkísérletekbe.

Tanácsok fiatal nyomozók számára

Dr Topol: Ez elég feltűnő. Még mindig meglehetősen fiatal nyomozó.

A már említettek mellett van más üzenete, amelyet tovább kell küldenie a Medscape fiatalabb embereinek arról, hogyan kell folytatni a karriert?

Dr Butte: Az egyik dolog, amit megtanultam a Szilícium-völgyben az elmúlt 10 évben, az, hogy már nem helyénvaló, ha óvatos vagyok egy akadémiai laboratórium felállításában. Bizonyos értelemben egy vadonatúj tudományos laboratórium indítása olyan, mintha egy induló vállalkozás számára finanszírozást kapnánk. Ha 3 év alatt nem fogja megváltoztatni a világot, akkor sem a Sand Hill Roadon, sem a Maryland-i Bethesda tanulmányi szakaszában szereplőket nem fogja meggyőzni a befektetőkről. Nagyon sok szinergia van ezekben a szerepekben.

Az újító mai szerepe az, hogy meggyőzzen egy embereken teli szobát, hogy pénzt adjon ötleteinek végrehajtásához. Ha megkapja ezt a pénzt, 3 év alatt meg kell változtatnia a világot.

A jövő kutatója nagyon nagy jelentőségű projektekre fog gondolni. Lő, hogy megváltoztassa a világot. Hagyja hátra a konzervativizmust. Ez lenne a tanácsom.

Dr Topol: Ez elég erős dolog. Hallottam ezt a Szilícium-völgy és az NIH összehasonlítását, és hogyan lehet fellebbezni mindkettőhöz.

Dr Butte: A feleségem ezt tíz évvel ezelőtt tanította nekem.

Dr Topol: Nagyon köszönöm, hogy csatlakozott hozzánk a Medscape One-on-One-ra. Ön természetesen az orvostudomány egyik legérdekesebb embere, és sok sikert kívánok neked az UCSF új programjában.

Dr Butte: Nagyon köszönöm. Köszönöm, hogy itt vagyok.